Historia

27/lut/2023
07/paź/2024

Tematyka badań

Obszary badawcze Katedry i Zakładu Mikrobiologii SUM obejmują:

I. Mechanizmy tworzenia biofilmu przez gronkowce koagulazoujemne (CNS) w zależności od warunków środowiskowych i charakteru działających na nie czynników

  • Określenie przynależności gatunkowej badanych szczepów gronkowców
  • Ocena polimorfizmu wyizolowanych szczepów technikami ITS-PCR i PFGE.
  • Analiza fenotypową i genotypową zdolności wytwarzania biofilmu in vitro przez szczepy CNS w obecności subinhibicyjnych dawek antybiotyku.
  • Określenie minimalnego stężenia hamującego wybranych antybiotyków b-laktamowych
    i makrolidowych dla poszczególnych szczepów CNS.
  • Ocena fenotypowych i genotypowych mechanizmów oporności na antybiotyki beta-laktamowe i makrolidowe.
  • Analiza wpływu różnych stężeń antybiotyków b-laktamowych i makrolidowych na proces tworzenia biofilmu w zależności od czasu ekspozycji.

 II. Potencjał degradacyjny i bioremediacyjny bakterii w stosunku do wybranych związków organicznych charakteryzujących się szerokim spektrum negatywnego oddziaływania na środowisko i człowieka

  • Identyfikacja szczepów bakterii zdolnych do degradacji antybiotyków, NLPZ i hormonów
    przy wykorzystaniu metod biochemicznych i genetycznych
    i ocena ich potencjału degradacyjnego
  • Badanie mechanizmów rozkładu antybiotyków, antybiotyków, NLPZ i hormonów mikroorganizmy.
  • Badania nad wykorzystanie mikroorganizmów w procesach bioremediacji gleb skażonych wybranymi antybiotykami, NLPZ i hormonami.
  • Badanie oporności na antybiotyki u bakterii izolowanych ze skażonych gleb.
  • Ocena aktywności mikrobiologicznej gleb skażonych antybiotykami, NLPZ i hormonami.
  • Ocena zmian w bioróżnorodności i strukturze zespołów bakterii w glebach skażonych antybiotykami, NLPZ i hormonami przy wykorzystaniu technik hodowlanych oraz markerów biochemicznych (FAME, PLFA) i molekularnych (DNA). 

 III. Wirusowe i osobnicze czynniki modyfikujące patogenezę zakażeń

  • Charakterystyka zróżnicowania genetycznego HIV-1 i określanie częstości występowania poszczególnych podtypów wirusa krążących w Polsce południowej.
  • Monitorowanie rozwoju epidemii i szerzenia się HIV-1 w Polsce południowej na podstawie analizy filogenetycznej sekwencji genów wirusowych.
  • Charakterystyka zróżnicowania genetycznego SARS-CoV-2 i określanie częstości występowania poszczególnych podtypów wirusa krążących w Polsce.
  • Monitorowanie rozwoju epidemii i szerzenia się SARS-CoV-2 w Polsce na podstawie analizy filogenetycznej sekwencji genów wirusowych.
  • Ocena typu i częstości występowania mutacji związanych z opornością HIV-1 na leki przeciwretrowirusowe.
  • Charakterystyka populacji osób seropozytywnych pod względem polimorfizmów alleli wpływających na tempo progresji zakażenia i efektywność stosowanych strategii terapeutycznych w zakażeniach wirusowych.

W kategorii: